Post-doctorant en analyse de sensibilité dans un modèle d’électro-cardiologie

Vous souhaitez participer à un projet innovant en recherche cardiaque ?

Rejoignez l'Institut des Maladies du Rythme Cardiaque (IHU Liryc), de l'Université de Bordeaux ! Le Liryc est organisé en équipes de recherche clinique qui travaillent en étroite collaboration avec des équipes de sciences fondamentales. Son objectif est d’offrir une plateforme de recherche médicale unique ainsi qu’un pôle de formation accueillant des étudiants et chercheurs du monde entier.

Au sein de l’équipe Carmen qui fait partie du Pôle Modélisation, nous concevons et analysons de nouveaux modèles numériques pour simuler l’activité électrique et mécanique du cœur.

En étroite collaboration avec l’Inria, et dans le cadre du projet européen SimCardioTest, nous recrutons un∙e Post-Doctorant∙e en analyse de sensibilité dans un modèle d’électro-cardiologie.

Votre mission consistera à réaliser l’analyse de sensibilité et de propagation d’incertitudes dans un modèle d’excitation cardiaque par un stimulateur (pacemaker). Le modèle est constitué d’équations aux dérivées partielles de réaction – diffusion (modèle bidomaine) couplé par des conditions aux limites à des équations différentielles.

Des solutions approchées sont calculées par éléments finis grâce à un code de calcul en C++ (CEPS – Cardiac Electrophysiology Solver).

Ce modèle numérique est utilisé pour calculer des courbes de seuil de stimulation appelées courbes de Lapicque.

Le projet de recherche consiste à étudier la sensibilité des courbes de Lapicque aux différents paramètres du modèle et étudiés l’effet des incertitudes des paramètres les plus influents.

Le modèle a été établi dans la première partie du projet. Nous devons maintenant mener les activités de validation du modèle qui reposent sur l’exploitation de données expérimentales et cette analyse de sensibilité. Ces activités sont guidées par le document V&V40 de l’ASME (American Society Of Mechanical Engineering). Elles ont été décrites en détail dans un délivrable du projet.

Ainsi, vos activités comprennent plusieurs axes :

# Mathématiques appliquées et calcul de haute performance

• Vous organisez des expérimentations virtuelles sur ordinateur et analysez les données produites
• Vous conduisez les simulations en environnement de calcul haute performance (HPC) et écrivez les outils de traitement de données pour analyser les résultats

# Communication scientifique

• Vous contribuez à la rédaction de communications scientifiques
• Vous participez à des manifestations scientifiques

Titulaire d’un diplôme de Doctorat en Mathématiques Appliquées ou Calcul Scientifique, vous avez de solides connaissances des modèles par équation aux dérivées partielles et de l’analyse se sensibilité de ce type de modèle.

• Vous êtes autonome dans votre organisation de travail
• Vous maîtrisez la programmation en Python, C++ (appréciée) et savez utiliser des codes de calcul scientifique
• Vous faites preuve d’un esprit d’analyse
• Vous aimez travailler en équipe projet et savez partager vos résultats
• Vous maîtrisez l’anglais (niveau C1 / B2) écrit et oral dans un contexte de travail multiculturel

Vous vous reconnaissez ? Postulez !