Ingénieur en bio-informatique

L’Université de Bordeaux est une grande université dynamique, responsable, attentive au bien-être de ses personnels. La rejoindre, c’est travailler dans un cadre privilégié au sein d’une communauté professionnelle particulièrement diverse et ouverte, en bénéficiant de dispositifs d’accueil et d’inclusion, de formation et de mobilité interne. C’est participer à une aventure académique, scientifique et humaine. C’est s’engager à relever les défis du XXIe siècle.

Rejoignez le laboratoire ImmunoConcEpT – de l’Université de Bordeaux !

Nos programmes de recherche s'intéressent au système immunitaire en situation physiologique et pathologique. Le laboratoire regroupe une centaine de personnes et est constitué de plusieurs équipes avec des thématiques de recherche variées, dont une travaillant sur la philosophie des sciences et interagissent avec les différentes équipes.

Dans le cadre du projet HORUS (Casting Light on HOst-cytomegaloviRUs interaction in Solid organ transplantation), nous recrutons un Ingénieur en bio-informatique F/H.

Financé par Horizon Europe pour une durée de 5 ans, le projet implique 16 partenaires issus de 7 pays européens : France, Belgique, Allemagne, République Tchèque, Espagne, Italie, Suisse.  Le consortium regroupe des acteurs académiques, économiques, hospitaliers et centres de transfert technologique.

L’objectif de ce projet est d’améliorer notre compréhension de la relation « hôte-virus » entre le cytomégalovirus (CMV) et les receveurs de greffes d'organes solides pour découvrir des signatures intégrant les caractéristiques virales, cliniques et immunologiques associées au contrôle du CMV.

Le but ultime est de diminuer l'incidence du CMV, de mieux gérer les infections difficiles à traiter, d'éviter l'utilisation de thérapies antivirales inutiles, et de découvrir de nouvelles molécules capables de cibler spécifiquement la réponse immunitaire du CMV sans augmenter le risque de rejet aigu.

Intégré à l’équipe « Vulnerability and ageing of the immune system », du laboratoire et encadré par la Responsable Scientifique du projet HORUS, votre mission se concentrera sur l’analyse des jeux de données produits au sein du laboratoire : analyse OMICs de cytométrie et de single cell RNAseq principalement.

# Bio-informatique

• Vous analysez les jeux de données de scRNAseq et de cytométrie sur une cohorte humaine
• Vous procédez à l’analyse d’un jeu de données de scRNAseq sur des lymphocytes murins

# Contribution au projet et à la vie du laboratoire

• Vous partagez vos résultats lors de réunions d’équipe et du consortium
• Vous participez aux assemblées et aux workshops d’HORUS
• Vous contribuez aux tâches communes à la vie d’un laboratoire

Titulaire d’un diplôme de Master 2 ou d’Ingénieur en sciences des données ou bio-informatique vous avez idéalement une spécialisation en immunologie et une expérience de 3 à 5 ans en analyse de jeux de données biologiques.

• Vous êtes autonome dans vos travaux et savez travaillez en équipe
• Vous faites preuve de bonnes qualités relationnelles, y compris en anglais (niveau C1 souhaité)
• Vous maîtrisez R

Vous vous reconnaissez ? Postulez-vite !